【基本信息】
职称：副研究员，硕士生导师
研究方向：（1）基于人工智能的免疫微环境相关分析及算法研究；（2）免疫细胞时空分布与功能状态量化研究
电子邮箱：linyt@fzu.edu.cn
办公室：福州大学旗山校区国家大学科技园7号楼518
【个人简介】
林雅婷，女，福州大学医工交叉研究院副研究员、硕士生导师。本科与博士毕业于厦门大学。近年来主要聚焦于人工智能驱动的免疫微环境分析及算法开发、细胞反卷积算法、免疫细胞时空分布与功能状态量化等方向的研究。已在Patterns、Communications Medicine、Nature communications、STAR Protocols等国际知名期刊发表多篇学术论文，并作为核心成员参与Tumor Deconvolution DREAM Challenge国际联盟研究。曾获Cell出版社2022年度中国论文奖。
【招生信息】
目前硕士招生专业：人工智能（085410），计算机技术 (085404)。
诚邀对“AI for Science”交叉领域抱有热忱，渴望用算法赋能医学研究的同学报考研究生。同时，热烈欢迎对人工智能与生命科学结合方向感兴趣的本科生联系交流，可探讨学术兴趣、参与科研实践或项目合作。
【主要科研项目】
福州大学，校人才科研启动基金（XRC-25100），主持
【代表性学术成果】（#共一，*通讯）
1. Brian S. White, Aurélien de Reyniès, Aaron M. Newman, Joshua J. Waterfall, Andrew Lamb, Florent Petitprez, Yating Lin, Rongshan Yu,…,Andrew J. Gentles*. Community assessment of methods to deconvolve cellular composition from bulk gene expression, Nature Communications, 2024.
2. Xu Xiao, Yating Lin, Lei Zhang, Wenxian Yang, Rongshan Yu*. A Statistical Approach for Improving Image Quality and Cell Quantification from Imaging Mass Cytometry, 9th International Conference on Communication, Image and Signal Processing, 2024.
3. Hao Li#, Yating Lin#, Ying Chen, Sijie Lin, Zhibin Huang, Wenxian Yang, Wei Li*, Rongshan Yu*. Detect the Unseen: An Expandable Detection Model for Stem Cell Images, IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, 2023.
4.Yating Lin#, Haojun Li#, Xu Xiao, Lei Zhang, Kejia Wang, Jingbo Zhao, Minshu Wang, Frank Zheng, Minwei Zhang, Wenxian Yang*, Jiahuai Han*, Rongshan Yu*. DAISM-DNNXMBD: Highly accurate cell type proportion estimation with in silico data augmentation and deep neural networks, Patterns, 2022.
5.Yating Lin, Shangze Wu, Xu Xiao, Jingbo Zhao, Minshu Wang, Haojun Li, Kejia Wang, Minwei Zhang, Frank Zheng, Wenxian Yang, Lei Zhang*, Jiahuai Han*. Rongshan Yu*.Protocol to estimate cell type proportions from bulk RNA-seq usingDAISM-DNNXMBD, STAR Protocols, 2022.
6.Xu Xiao#, Qian Guo#, Chuanliang Cui#, Yating Lin, Lei Zhang, Xin Ding, Qiyuan Li, Minshu Wang, Wenxian Yang, Yan Kong*, Rongshan Yu*. Multiplexed imaging mass cytometry reveals distinct tumor-immune microenvironments linked to immunotherapy responses in melanoma, Communications Medicine, 2022.
7.Wenxian Yang, Yating Lin, Shiyao Wu, Rongshan Yu*. Improving Coding Efficiency of MPEG-G Standard Using Context-Based Arithmetic Coding,IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, 2018.
8.林雅婷，杨文娴，俞容山，RNA表达量的变化作为检测靶标在制备预测癌症免疫治疗预后情况的试剂盒中的应用，中国专利，CN116779032A，2023.09.19.
9.李豪，俞容山，林雅婷，肖旭，一种基于CLIP的开集类器官定位识别方法，中国专利，CN115937586A，2023.04.12.
