基本信息
职称:副教授、硕士生导师
研究方向:(1)人工智能:聚焦于医学大数据的建模和挖掘;(2)生物信息学:聚焦于肿瘤多组学数据解析、肿瘤演进图谱绘制和机制探索
电子邮件:luoshangyi@fzu.edu.cn
工作经历
2022年-2023年哈尔滨医科大学公共卫生学院副教授
2020年-2022年哈尔滨医科大学公共卫生学院助理研究员
2020年-2023年哈尔滨医科大学基础医学院博士后
教育背景
2015年-2020年哈尔滨医科大学生物医学工程(生物信息学方向)医学博士
2010年-2015年哈尔滨医科大学生物技术(生物信息学方向)理学学士
主要科研课题
1、国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,62102122,整合癌症多组学数据解析肿瘤进化路径及其临床分型的研究,2022-01至2024-12,30万,在研,主持
2、中国博士后科学基金会,面上项目,2020M681111,基于癌症克隆进化识别胶质瘤分子亚型,2021-01至2022-12,8万,结题,主持
3、黑龙江省科学院,科研业务费(A类),发育相关疾病的遗传及表观遗传基础研究平台,2021-01至2023-12,200万,结题,主要参与人
4、黑龙江省博士后科学基金会,面上项目,LBH-Z20170,整合癌症多组学数据解析肿瘤进化轨迹,2021-01至2022-12,5万,结题,主持
5、哈尔滨医科大学,研究生创新科研项目,YJSCX2017-18HYD,搭建癌症进展特异的基因组变异事件综合信息平台,2017-01至2018-12,2万,结题,主持
近五年发表的主要论文(†第一作者;*通讯作者)
1、Shangyi Luo†, Ying Jia, Yajing Zhang*, Xue Zhang*. A transcriptomic intratumor heterogeneity-free signature overcomes sampling bias in hepatocellular carcinoma risk classification (JHEP Rep;2023;IF=8.3;中科院一区).
2、Shangyi Luo†,*, Yajing Zhang†, Ying Jia, Xue Zhang*. Comprehensive analysis of intratumoural heterogeneity of somatic copy number alterations in diffuse glioma reveals clonality-dependent prognostic patterns (Neuropathol Appl Neurobiol;2022;IF=5.0;中科院二区).
3、Yajing Zhang†,*,Shangyi Luo†, Ying Jia, Xue Zhang*. Telomere maintenance mechanism dysregulation serves as an early predictor of adjuvant therapy response and a potential therapeutic target in human cancers (Int J Cancer;2022;IF=6.4;中科院一区).
4、Shangyi Luo†, Shiwei Zhu†, Jianlong Liao†, Yajing Zhang†, Xiaobo Hou, Tao Luo, Jinyuan Xu, Lin Pang, Xin Liang, Yun Xiao*, Xia Li*. IDH clonal heterogeneity segregates a subgroup of non-1p/19q codeleted gliomas with unfavourable clinical outcome (Neuropathol Appl Neurobiol;2021;IF=6.25;中科院二区).
5、Shangyi Luo†, Yajing Zhang†, Yiran Yang†, Shiwei Zhu, Wei Liu, Jiali Zhu, Xin Liang, Zedong Jiang, Shangqin Sun, Xiaobo Hou, Yun Xiao*, Xia Li*. Clonal Tumor Mutations in Homologous Recombination Genes Predict Favorable Clinical Outcome in Ovarian Cancer (Gynecol Oncol;2020;IF=5.482;中科院一区).
6、Yulan Deng†,Shangyi Luo†, Chunyu Deng†, Tao Luo, Wenkang Yin, Hongyi Zhang, Yong Zhang, Xinxin Zhang, Yujia Lan, Yanyan Ping, Yun Xiao*, Xia Li*. Identifying mutual exclusivity across cancer genomes: computational approaches to discover genetic interaction and reveal tumor vulnerability (Brief Bioinform;2019;IF=8.99;中科院一区).
7、Hongyi Zhang†,Shangyi Luo†, Xinxin Zhang†, Jianlong Liao†, Fei Quan, Erjie Zhao, Chenfen Zhou, Fulong Yu, Wenkang Yin, Yunpeng Zhang, Yun Xiao*, Xia Li*. SEECancer: a resource for somatic events in evolution of cancer genome (Nucleic Acids Res;2018;IF=11.147;中科院一区).
8、Yulan Deng†,Shangyi Luo†, Xinxin Zhang†, Chaoxia Zou†, Huating Yuan, Gaoming Liao, Liwen Xu, Chunyu Deng, Yujia Lan, Tingting Zhao, Xu Gao*, Yun Xiao*, Xia Li*. A pan-cancer atlas of cancer hallmark-associated candidate driver lncRNAs (Mol Oncol; 2018;IF=5.962;中科院二区).