基本信息
职称：副教授、硕士生导师
研究方向：基于人工智能的肿瘤大数据平台构建、机制研究及模型开发
电子邮件：xiongzhuang@fzu.edu.cn
教育背景
2017年-2023年中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心） 生物信息学博士
2013年-2017年华中科技大学生物信息学学士
主要科研项目
1、大数据平台搭建
人类DNA甲基化芯片数据库（EWAS Data Hub）的构建（2018-2019，第一完成人）
表观基因组关联研究数据库平台（EWAS Open Platform）的构建（2021-2022，第一完成人）
2、算法开发
DNA甲基化芯片数据批次效应及标准化方法（GMQN）的开发（2018-2021，第一完成人）
表观基因组关联研究在线分析工具EWAS Toolkit的开发（2020-2022，共同第一完成人）
3、分析应用
利用多组学数据整合分析COVID-19患者单细胞层面的甲基化变异（2021-2022，共同第一完成人）
获奖及荣誉
1、北京市普通高等学校优秀毕业生（2023年）
2、中国科学院大学优秀毕业生（2023年）
3、国家奖学金（2022年）
4、中国科学院院长优秀奖学金（2022年）
5、中国科学院优秀共青团员（2021年）
6、中国科学院大学三好学生（2020-2021年度，2021-2022年度）
7、复旦大学博士生论坛报告三等奖（2019年）
8、中国科学院精准医学前沿论坛报告优秀奖（2019年）
学术兼职
Genomics, Proteomics & Bioinformatics青年编委、Frontiers in Genetics客座编委
近五年发表的主要论文
1．Wang G#, Wu S#,Xiong Z#, Qu Z, Fang X, Bao Y: CROST: a comprehensive repository of spatial transcriptomics.Nucleic Acids Res2023. (IF=14.9)
2．Li H#, Wu S#, Li J#,Xiong Z#, Yang K#, Ye W#, Ren J, Yang Y ,Bao Y, Zhang W: HALL: a comprehensive database for human aging and longevity studies.Nucleic Acids Res2023. (IF=14.9)
3．Xiong Z, Yang F, Li M, Ma Y, Zhao W, Wang G, Li Z, Zheng X, Zou D, Zong W, Kang H, Jia Y, Li R, Zhang Z, Bao Y: EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit for epigenome-wide association study.Nucleic Acids Res2022. (IF=19.16)
4．Xiong Z, Li M, Yang F, Ma Y, Sang J, Li R, Li Z, Zhang Z, Bao Y: EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata.Nucleic Acids Res2020. (IF=19.16)
5．Xiong Z, Li M, Ma Y, LI R, Bao Y: GMQN: A reference-based method for correcting batch effects as well as probes bias in HumanMethylation BeadChip.Frontiers in Genetics2022. (IF=4.77)
6．Wang G#,Xiong Z#, Yang F, Zheng X, Zong W, Li R, Bao Y: Identification of COVID-19-Associated DNA Methylation Variations by Integrating Methylation Array and scRNA-Seq Data at Cell-Type Resolution. Genes 2022. (IF=4.14)
7．Xiong Zas theco-first authorin CNCB-NGDC Members and Partners: Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2024.Nucleic Acids Res2023. (IF=14.90)
8．Xiong Zas theco-first authorin CNCB-NGDC Members and Partners: Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2023.Nucleic Acids Res2023. (IF=19.16)
9．Xiong Zas theco-first authorin CNCB-NGDC Members and Partners: Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022.Nucleic Acids Res2022. (IF=19.16)
10．Xiong Zas theco-first authorin CNCB-NGDC Members and Partners: Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021.Nucleic Acids Res2021. (IF=19.16)
11．Xiong Zas theco-first authorin BIG Data Center Members: Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020.Nucleic Acids Res2020. (IF=19.16)
12．Sun Y, Zheng X, Wang G, Wang Y, Chen X, Sun J,Xiong Z, Zhang S, Wang T, Fan Z, Bu C, Bao Y, Zhao W: MACdb: A curated knowledgebase for metabolic associations across human cancers.Molecular Cancer Research2023.(IF=5.2)
13．Zong W, Kang H,Xiong Z, MA Y, Jin T, Gong Z, Yi L, Zhang M, Wu S, Wang G, Bao Y, Li R: scMethBank: a database for single-cell whole genome DNA methylation maps.Nucleic Acids Res2022. (IF=19.16)
14．Zheng X, Zong W, Li Z, Ma Y, Sun Y,Xiong Z, Wu S, Yang F, Zhao W, Bu C, Du Z, Xiao J, Bao Y: CCAS: One-stop and comprehensive annotation system for individual cancer genome at multi-omics level.Frontiers in Genetics2022. (IF=4.77)
15．Zhang M, Zong W, Zou D, Wang G, Zhao W, Yang F, Wu S, Zhang X, Guo X, Ma Y,Xiong Z, Zhang Z, Bao Y, Li R: MethBank 4.0: an updated database of DNA methylation across a variety of species.Nucleic Acids Res2022. (IF=19.16)
16．Hongen Kang, Xiuli Zhu, Ying Cui,Xiong Z, Wenting Zong, Yiming Bao, Peilin Jia: A comprehensive benchmark of transcriptomic biomarkers for immune checkpoint blockades.Cancers2023.(IF=5.2)
